يمتلك خل التفاح خصائص مميزة إذ يعتبر مادة مضادة للبكتيريا والميكروبات كما أنه من مضادات الأكسدة القوية، بالإضافة إلى أن فوائد خل التفاح للبشرة والجسم عديدة، فهو يساعد على تخفيف الوزن ويزيد من معدل حرق الدهون ويضبط مستويات الكوليسترول في الجسم، وقد يساعد في علاج الكثير من مشاكل البشرة مثل التجاعيد وحروق الشمس والحبوب وخاصةً حب الشباب. ولكن ينبغي الإنتباه إلى كمية الخل المستخدمة وطريقة الإستخدام سواء عند استهلاكه عن طريق الفم أو عند استخدامه بشكل مباشر على الوجه أو البشرة ، وذلك لأنه عند الإسنخدام الخاطىء لخل التفاح أو استخدامه بكميات كبيرة قد يضر بالبشرة و قد يسبب حروق على الجلد، كما أنه قد يضر بالأسنان عند الإفراط في استخدامه.
يستخدم خل التفاح لعلاج الكثير من الأمراض الجلدية مثل جفاف الجلد والأكزيما، كما يمكن أن يعمل خل التفاح على توازن درجة الحموضة في البشرة، بالإضافة إلى أنه أنه يساعد في التخلص من البقع والبكتيريا وتقليل الإلتهابات ويحمي البشرة وقد يستخدم كغسول للوجه أو تونر. ولكن يجب دائما تخفيف خل التفاح عند استخدامه بشكل مباشر على الوجه، إذ قد يسبب خل التفاح المركز حروق أو تهيج للبشرة. وقد يستخدم خل التفاح لعلاج حب الشباب حيث يعمل كمقشر بسبب خصائصه المضادة للبكتيريا، كما قد يساعد على علاج آثار حب الشباب، وينصح بوضع خل التفاح المخفف على المنطقة المصابة لمدة ربع ساعة مرتين يومياً.
إن أفضل طريقة للإستفادة من فوائد خل التفاح هي عن طريق استخدامه في الطبخ، حيث يمكن أن يضاف خل التفاح للسلطات بجميع أنواعها ليعطي نكهة مييزة وفوائد إضافية للسلطة، كما يمكن إضافته للمايونيز. ومن الممكن أيضاً شرب خل التفاح ولكن بعد تخفيفه بالماء بنسبة من ملعقة صغيرة إلى ملعقتين كبيرتين لكل كوب كبير من الماء الفاتر وشربه بشكل يومي، وقد يرغب بعض الأشخاص بإضافة الزنجبيل والعسل إلى خل التفاح لتعديل الطعم وتعزيز االنكهة؛ وذلك عن طريق اضافة ملعقة كبيرة من خل التفاح ونصف ملعقة صغيرة من الزنجبيل المطحون وملعقة صغيرة من العسل إلى كوب من الماء الفاتر.
لا ينصح باستهلاك أكثر من ملعقتين كبيرتين من خل التفاح يومياً وذلك لتجنب الآثار الجانبية للخل؛ إذ أنه قد يضر بمينا الأسنان كما أنه قد يتفاعل مع بعض أنواع الأدوية. وينصح باستهلاك ملعقة صغيرة لكل كوب في البداية ومن ثم يمكن زيادتها تدريجياً وحسب الحاجة إلى ملعقتين كبيرتين يومياً. كما يفضل استخدام خل التفاح الطبيعي الغير مصفى لاحتوائه على نسبة من البروتين والبكتيريا النافعة.